保護投資者尤其是中小投資者的合法權益是本次改革的宗旨。《意見》從五個方面制定措施，加強投資者保護：一是促進發行人使用淺白語言，真實、準確、完整地披露公司情況，加強風險揭示，讓投資者明明白白投資。二是促進公平合理定價，限制發行人定高價，防止投資者報高價，抑制上市后盲目炒作新股。比如，把減持與發行價掛鉤，要求發行人制定股價穩定預案，定價時要先去掉報價最高的10％的申購量等。三是新股配售尊重中小投資者申購意愿，調整回撥機制和網上配售機制，如果中小投資者申購踴躍，網上發行股票的數量最高可達公開發行股票總數的80％，網上配售機制將更加有利于中小投資者申購。四是強化信息披露違法行為的賠償責任。因信息披露違法行為給投資者造成損失的，發行人及其控股股東、相關中介機構等責任主體必須依法賠償投資者損失；信息披露嚴重違法，影響對發行人上市條件的判斷的，將要求發行人回購已經發行的新股，要求控股股東購回已經轉讓的限售股等等。五是加強監管執法，堅決打擊違法違規行為，建立投資者保護的法律保障。
